Nach dem ihr herausgefunden habt, dass Käptn Tetra in Wirklichkeit Prinzessin Zelda ist, reist zu den Orten, die auf der Seekarte markiert sind (Zephirinsel im Norden und Terrainsel im Süden). Sucht zuerst den Wirbelsturm, um vom Gott des Windes den Kanon des Sturms zu erlernen. Teleportiert euch nun zum Wirbelsturm, der sich auf der Karte links oben befindet. Ihr trefft dort auf die Königin der Feen und erhaltet dort die Feuer- und Eispfeile.
Reist noch einmal zu den beiden Inseln im Norden und Süden und füttert die Fische. Die Orte werden in die Karte eingezeichnet und sie veraten euch, dass es in bestimmten Gebieten Gegenstände gibt, die euch in die Höhlen bringen (Eisenstiefel in einer Eishöhle und Kraftringe in der Ignisspitze). Erlernt dort die beiden Hymnen und ihr findet heraus, dass ihr eine Person finden müsst, die eine Harfe und eine Geige spielen.
Die mit der Harfe ist Melodie auf Drakonia und der mit der Geige ist ein Pflanzenwesen auf Tanntopia. Bringt den beiden die richtige Hymne bei und bringt sie zu der Insel, auf der ihr das jeweilige Lied erlernt habt.
Am Ende der Zwischensequenz bleibt Link allein im Turm zurück und das Wasser beginnt zu steigen. Rennt schnell den Steg hinauf. An den Bockblins könnt ihr einfach dran vorbeilaufen. Der riesige Vogel zerschlägt immer wieder den Steg, aber wenn ihr zügig durchspurtet, wird das nie zum Problem. Solltet ihr dennoch abstürzen oder einem ähnlichen Missgeschick zum Opfer fallen, kommt ihr mit dem Greifhaken wieder hinauf. Oben erwartet euch der große Vogel.
Schlagt ihm mit dem Stahlhamer auf den Schnabel. Auf dem Dach kommt es dann zum Kampf.
In Ebene 5 des ewigen Labyrinths ist ein Raum mit mehreren Nubisgarden, wie auf Capo Grande. In diesen Raum ist der äußere Ring durch Feuer blockiert, nicht wie auf Capo Grande. Ihr müsst zunächst die Rüstungen der Garden beseitigen, eigentlich nur den Brustpanzer. Das macht ihr mit der Spezial-Attacke . Und immer in Deckung bleiben. Wenn ihr alle Garden entrüstet habt, tänzelt in Kreisbahnen um sie, passt aber aufs Feuer auf. Der Sieg wird einfach sein, denn die Nubisgarden, ohne Rüstung schlagen sich immer selber und damit bringen sie sich selber um.
Um in den einen Tempel wo der riesige Felsen (sieht aus wie ein Gesicht) zu gelangen, benötigt ihr die Krafthandschuhe. Ihr findet sie in der Vulkaninsel. Ihr müsst sie aufsuchen und einen Eispfeil in den Vulkan schießen. Nun bekommt ihr einige Minuten Zeit in die Höhle zu gelangen. Drinnen müsst ihr dann zwei einäugige Schlangen besiegen und schon bekommt ihr die Krafthandschuhe. Nun könnt ihr den Felsen vor dem Eingang wegschaffen.
Geht auf die Insel Tantopia (F6) zum Wasserfall. Ihr hört und seht, dass Musik durch das Wasser dringt. Benutzt den Greifhaken und schwingt durch den rechten Wasserfall. Dahinter verbirgt sich eine Höhle. Geht zu Makorus und spielt direkt vor ihm die Hymne des Zephirgottes: . Das sind 6 Noten. Gemeinsam müsst ihr nur zur Zephir-Insel (D1) und vor der Steintafel noch einmal den Taktstock des Windes schwingen, sodass Link und Makorus zusammen musizieren. Dann treten beide in den ZEPHIR-TEMPEL ein.