Ihr beginnt das Spiel im Haus von Nico dem alten Lokführer. Link ist während seines Theaterstücks eigeschlafen und wird unsanft von Ferro geweckt, da er heute zum Lokführer von Prinzessin Zelda höchstpersönlich ernannt werden soll.

Dazu muss Link nach Norden laufen und zum Bahnhof gehen, wo Ferro bereits auf ihn wartet. Links Abschlussprüfung wird es sein in 5 Minuten (300 Sekunden) die Lok zum Schloss zu bringen. Dazu muss Link das Tempo des Zuges regulieren, das Vieh von den Schienen verjagen und die Weichen so umlegen, dass es zu keiner Kollision mit anderen Zügen kommt.

Am Bahnhof angekommen habt ihr eure Abschlussprüfung bestanden und müsst nun in den Norden der Stadt, Richtung Schloss, laufen, um mit der Zeremonie zu beginnen. Unterwegs trefft ihr noch den Postboten, der euch euren ersten Brief aushändigt.

Durchquert den Vorhof und redet mit den verschlafenen Wachen. Nach einer kurzen Unterhaltung werdet ihr ins Schloss gelassen. Begebt euch ins Erdgeschoss und redet mit der Wache, die den Audienzsaal bewacht, um hinein zu können. Betretet anschließend den Saal, wo die Zeremonie stattfindet. Albert gibt Prinzessin Zelda die Unterlagen und ihr erhaltet von Zelda, nach einem kleinen Gespräch, euer Lokführer Diplom.

Außerdem überreicht euch Zelda noch einen Brief, den ihr lesen sollt, wenn der böse Minister nicht in der Nähe ist. In dem Brief ist eine Botschaft von Prinzessin Zelda. Zelda möchte sich mit euch treffen um etwas zu bereden. Verlasst dazu den Audienzsaal und geht im Südosten in die Treppe auf dem Dach müsst ihr dann nach Norden durch den Durchgang gehen. (Im Brief von Zelda ist auch eine Wegbeschreibung enthalten).

Bei Zelda angekommen verrät sie euch, dass sie unbedingt zum Turm der Götter muss, da in letzter Zeit so viele Schienen verschwinden und das mit dem Turm zu tun haben muss. Ihr erhaltet eine Rekrutenuniform mit der ihr euch an den Wachen vorbeischleichen könnt. Lauft den ersten Gang so entlang das keiner der Wachen Zelda entdeckt.

Der Gartenbereich ist schon etwas schwieriger. Dort müsst ihr mit Link die Wachen ablenken (Ansprechen oder Steine hinwerfen) und dann mit Zelda eine Linie zeichnen auf der sie dann vorbei laufen kann. In Hyrule Stadt angekommen trefft ihr Ferro, dem ihr alles erzählt. Anschließend reist ihr weiter Richtung Götter Turm.

Unterwegs verschwindet die Schiene, die zum Turm führt. Ihr bemerkt wie sich der Turm in Dunkelheit hüllt und anschließend verwandelt wird. Im selben Moment taucht der böse Minister Draiis mit seinem Gefolgsmann Derek auf. Beide überrumpeln Ferro & Link und entführen Prinzessin Zelda.

Ihr wacht in den Kabinen der Wachen auf und erklärt Albert die Lage. Als ihr wieder raus gehen wollt, erscheint der Geist von Prinzessin Zelda und ihr folgt ihm in Zeldas Gemächer. Glücklicherweise kann Link Zelda sehen, im Gegensatz zu den anderen Bewohnern Hyruls. Zelda "gibt" euch ihre Flöte und ihr macht euch erneut auf den Weg zum Turm. Dazu geht ihr über den Audienzsaal zum Hinterausgang vom Schloss.

Doch die Wache lässt euch nicht ohne Ausrüstung durch. Deshalb müsst ihr zum Trainingsraum des Schlosses gehen und euch ein Schwert besorgen. Dazu müsst ihr ein kurzes Schwert Tutorial ablegen. Zusätzlich könnt ihr euch draußen in der Stadt beim Händler noch ein Schild kaufen. Solltet ihr euch ausgerüstet haben, könnt ihr euch erneut zum Hinterausgang des Schlosses begeben um eure Reise zum Turm fortzusetzen.

Draußen angekommen könnt ihr erstmal einer Wache helfen, die von Monstern angegriffen wird. Anschließend lauft den Weg weiter nach Norden und legt mit einer Bombe den Weg zu einer Höhle frei.