Im folgenden werden nur die schwierigsten Missions erklärt und gelöst, da die meisten sehr einfach und selbsterklärend sind.

Je nachdem, auf welchem Schwierigkeitsgrad man die Mission meistert, erhält man entweder ein Bronze-, Silber-, oder Goldabzeichen. Die Maximalpunktzahl im Schwierigkeitsgrad Leicht liegt bei 50000 Punkten, auf Normal bei 60000 Punkten und auf Schwer bei 70000 Punkten.

Mission 5 ist eine der schwierigsten Mission überhaupt. Diese Mission ist selbst auf Leicht nur sehr schwer zu schaffen. Es ist eigentlich egal, welchen der vier Turtles ihr nehmt. Es kommt vor allem darauf an, dass ihr sofort zu Beginn einen Wandsprung ausführt, um Karai daran zu hindern, Splinter Schaden zuzufügen. Ansonten ist bei dieser Mission wirklich stures Üben angesagt, da es keine weiteren Tipps gibt.

Mit Leonardo oder dem Ultrominator ist Mission 8 am einfachsten zu schaffen, da ihre A-nach rechts-Attacke die Foot Ninjas am weitesten nach links befördet. Koppelt zuerst den Guterwagen, auf dem die zwei Container stehen, ab, bevor ihr beginnt, die Foot Ninjas vom Zug zu stoßen. Stellt euch dabei so nah, wie möglich an den linke Rand und schleudert dann die Foot Ninjas mit einem gezielten A-nach rechts-Angriff aus dem Bildschirm. Passt dabei aber auf, dass ihr nicht selbst aus dem Bildschirm verschwindet.

Ihr müsst als Michelangelo als erster der Turtles eine Pizza essen. Dabei kommt es nicht nur darauf an, dass ihr schnellsmöglichst einen der drei anderen Turtles besiegt, sondern dass ihr auch die Pizza in der Kiste esst. Es könnte aber sein, dass einer der anderen Turtles euch die Pizza vor den Nase wegfrisst. Im schlimmsten Fall müsst ihr alle drei Turtles besiegen, bevor ihr die Pizza essen könnt.

Mission 16 ist deshalb so schwer, da ihr von den gegebenen 10 Sekunden nur 5 Sekunden Zeit habt, um Leonardo und Splinter k.o. zu schlagen. Denn die Sterbensanimation beider Figuren dauert exakt 5 Sekunden. Der Foot Ninja kann die schnellsten Attacken ausführen. Wenn alles richtig verläuft und ihr sofort nach Kampfbeginn einen B-nach rechts-Angriff ausführt, sollten Leonardo und Splinter zu Boden gehen und die Zeit bei 4'86 Sekunden anhalten. Die einzige Bedingung, die vom Zufall abhängt, ist dass Splinter zu Beginn einen Sprung nach rechts ausführt, damit er ebenfalls von der schnellen Attacke des Foot Ninjas getroffen wird. Somit liegt die Maximalpunktzahl bei Mission 16 bei 40500 Punkten.